很多小白财务会计，在进行增值税纳税申报时，想必经常会遇到这种情况：申报系统自动计算生成的金额与账务金额或发票金额不一致；结遇到这样的情况我们该怎么处理呢？答案如下：

一、一般纳税人的增值税差异处理

1、纳税申报处理

一般纳税人在填写增值税申报表附表（一）的时候，需要先填写适用不同计税方法和不同税率的各开票类型销售额（不含税），之后系统会根据销售额和适用税率或征收率计算销项税额。在这个过程中就会出现系统自动计算的销项税额与发票汇总的销项税总额有差异，这时我们需要手动修改各开票类型对应的销项税额。因申报表与开票系统有相应的勾稽关系，所以附表（一）中各开票类型的销项税必须与开票系统保持一致。

在此之后，“扣除后”的销项税额也需要收到调整，因为此销项税是根据含税销售额计算而来的，与发票汇总的销项税总额一般也会有差异，同样需要手动修改。而这个销项税额也会直接引申到主表的销项税额，此处如果不修改为正确的销项税，那么会导致主表数据错误。

2、差错处理

如果你因未对销项税进行修改而导致发票销项税汇总额与申报数据不一致，是改账还是更正申报？答案是进行更正申报。因为发票是我们进行核算和申报的依据，所以我们不论是核算的信息还是纳税申报的数据都必须与发票的金额和税额保持一致。

二、小规模纳税人的增值税差异处理

1、纳税申报处理

小规模纳税人在进行增值税纳税申报时要比一般人简单，但是也有一个特点，那就是小规模申报表主表的应纳税额是根据不同征收率和不含税销售额汇总额计算得来的，而且应纳税额不能够手动修改。对于这个问题，不同人有不同的方法，有的人是以不含税销售额为准，应纳税额就根据系统的计算结果进行申报，与发票汇总的销项税偏差忽略不计。另外一种方法就是，通过修改不含税销售额来确保应纳税额与发票汇总的销项税额保持一致，而允许申报表的不含税销售额与发票汇总的不含税销售额存在一些偏差。

我就这两种纳税申报的处理方式咨询过我们当地的税务机关，税务机关给出的回复是：两种方式都可以，只要系统能够通过即可，纳税人由此导致的应纳税差异并不会产生税务风险。我的理解是，由于这种系统计算的结果与发票汇总的偏差本来也都是尾差，对应纳税额的差异极小。但以我个人观点来说，我会选取第二种方式，即申报表的应纳税额与发票的销项税额汇总保持一致，因为这样有利于保持应纳税额的核算不发生不必要的变动。

2、差错处理

如果你使用上面讲的第一种方式，会导致应纳税额与根据发票计提的应交增值税产生差异。那么我们就需要根据申报表的应纳税额对账务上的应交增值税进行调整，相应的也需要调整确认的收入。因应交增值税与收入的总和是固定的，就是应收账款的金额，所以如果调整应交增值税就需要相应的调整收入金额。

而选用第二种方式，由于会计处理上的应交增值税与申报表的应纳税额保持一致，就不需要调整应交增值税，也不需要调整收入。但是，账务上的收入额与申报表上的收入额不一致，这个需要保持关注，但不需要进行什么处理。